Muunilinst'te savaş devam ederken, Klon Savaşları pek çok gezegensel iç savaşa da yol açar. Commerce Guild tarafından desteklenmekte olan eski Mon Calamari senatörü Tikkes'in liderliğindeki Quarren Isolation League adlı grup, gezegeni
Cumhuriyet'ten tamamen koparmaya çalışmakta, bu yüzden hem Mon Calamari'ler hem de Cumhuriyet'e sadık Quarren'lerle savaşmaktadır. Cumhuriyet müdahele etmeye karar verir.

Jedi General Kit Fisto amfibik bir ırktan olduğu için bu göreve seçilir ve onun komutasındaki 9 Acclamator-sınıfı gemiden kurulu bir filo Mon Calamari'ye gelip okyanusa iner. Bayrak gemisinde Kit Fisto hologram aracılığıyla Yoda'yle görüştükten sonra harekete geçer.

Fisto, su altı savaşı için eğitilmiş ve donatılmış SCUBA klon askerlerle birlikte gemiden denize dalar, ışın kılıcını çeker su altında ve Quarren su altı şehirlerine doğru yüzmeye başlarlar. Şehrin savunma bataryaları ateş açar ve Manta Droid Subfighter
denen yeni model su altı droid savaşçıları da hangarlardan fırlayıp Fisto'nun birliklerine saldırır. Kit Fisto üstüne gelen bir Manta'yı ışın kılıcıyla ikiye böler.

Bu arada Droid Sub Carrier denen ve çok büyük droid yıldızsavaşçılarını andıran su altı taşıyıcı araçları ortaya çıkar. Klonlar bunlara saldırırken araçların alt kapakları açılır ve her biri tek bir savaş droidi tarafından kontrol edilen MVR-3 tipi mini
denizaltılar ortaya çıkar. Klonlar bunların bazılarını imha eder. Kit de Güç'ü kullanarak MVR-3'leri sağa sola itip onları kullanan droidleri oturdukları yerden atmaya başlar.

Bir Manta Droid Subfighter Kit Fisto'ya dört torpido fırlatır, ama Fisto üstüne gelen torpilleri rotalarından saptırıp başka Manta'ların üstünde patlatır.

MVR-3'ler saldırıya hazırlanırken bir borazan sesi duyulur, ve Mon Calamari Şövalyeleri Cumhuriyet güçlerinin yardımına koşar.
Balina-yılan balığı karışımına benzer keelkana denilen eğitilmiş hayvanlara binen bu Mon Calamari'ler gezegenin geleneksel savaşçı grubudur ve uzun süredir gömmüş oldukları savaş baltalarını Klon Savaşları başlayınca yeniden kuşanmışlardır.
Keelkana'lar sivri dişli dev çeneleriyle MVR-3 leri parçalarken binicileri de enerji mızraklarıyla Manta'ları avlar.

Kit Fisto da üstüne gelen Manta'larla savaşmaya devam ederken, okyanus tabanından yukarıya doğru birden metreler kalınlığında dev bir lazer ışını yükselir, su yüzeyine ulaşır ve oradaki Cumhuriyet Acclamator'larından birine isabet eder. Koca
gemi ikiye bölünür ve infilak eder. Az sonra lazerin kaynağı da dipteki bir çukurdan yukarıya doğru tırmanarak kendisini gösterir; Quarren Yengeç Aracı denilen altı bacaklı dev bir su altı walker'ıdır bu. Kit Fisto'nun endişeli bakışları altında bir kez
daha ateş eder, ama bu kez yüzeydeki Acclamator'lar sağa sola dağılarak kurtulurlar.

Kit Fisto hemen dev araca doğru yüzer, aracın Quarren mürettebatı ona hafif savunma taretleriyle ateş açarlar, ama Fisto tüm atışlardan kurtulur, onları geri yansıtarak savunma taretlerini yok eder. Sonra da Güç'ü kullanarak dev yoğunlaştırılmış su topları
oluşturur ve bunları Quarren aracının bacaklarına doğru fırlatır. Şok dalgaları bacaklarını parçalayınca araç çöker ve etkisiz hale gelir. Mon Calamari şövalyeleri de gelip keelkana'larıyla aracı çıktığı çukura geri iterler, araç düşer, düşer, ve en diplere ulaşınca patlar. Kit Fisto kulaktan kulağa sırıtır. Görünüşe göre Mon Calamari'de üstünlük artık Cumhuriyet taraftarlarının elindedir...