Çekimler için bir günlük izin alınmıştı. Ayrıca sarayın popülaritesinden dolayı turistler bölgeye ziyarete geliyordu. Tüm bu olumsuzluklarla ışığın çekimler için yeterli olmaması eklendi. David Tatersall: "Işık problemini çözmek için kullandığımız mekana herhangi bir ampul takamıyorduk. Aydınlatma için helyum balonlarını kullandık.Balonlar setin üzerinde geziniyordu.En sonunda yumuşak bir ışık elde etmeyi başarmıştık."

Yeni Kraliçeyi Hindistanlı oyuncu Ayesha Dharkes canlandıracaktı.Anakin Skywalker rolü için New York’ta bulunan Robin Gurland John Malkovich ile buluştu Gurland: “Malkovich onu Kaire Film Festivali'nde görmüş ve çok beğenmiş.Onun oyuncu hakkındaki fikirlerini duyunca Kraliçe Jamillia rolü için uygun olabileceğini düşündüm.” Aynı gün Gurland Shaft'ın çekimlerini sürdüren Samuel L. Jackson ile görüştü. Ayasha Dharker'in oynadığı ABD'de kısıtlı sayıda kopyası olan "The Terrorist” adli filmi ona ima etti.Şans eseri Jackson'da bu film vardı ve Gurland'a verdi. Gurland: "O gece filmi izledim ve bu kıza karşı iyi şeyler hissettim. Sonunda onunla Londra'da görüştüm.Kendisi de rolü beğendi. Sonunda Kraliçeyi bulmuştum."

Lucas Padme'nin ailesi ile buluştuğu sahneleri yorumluyor: "Padme'nin ailesi ile buluşması hoştu. Bu sahneleri Padme'nin politik yönü dışında da bir yönü olduğunu yansıtmak için düşünmüştüm. Filmi izlediğimde ise Padme'nin Anakin ile olan ilişkisinin Padme'nin ailesinin motivasyonu olmadan da diğer sahnelerde yeteri kadar islediğimi fark ettim. Aile sahnesi hoş bir arka plan hikayesiydi. Fakat filmin temposunu yavaşlatıyordu."

İç mekan çekimlerinin ardından 4 gün sürecek Villa Balbaniello'daki yemyeşil bahçeler ve muhteşem göl manzaralı inziva sahneleri vardı. Eylül 2000'in ilk haftası çekimler başladı. Lucas önceki yıllarda Avrupa'ya tatil için geldiğinde Como golünün kıyısındaki bu villayı fark etmişti. Lucas: "Bir seyahatimde Como golüne gitmiştim. Fakat bu sefer Villa’nın etrafında dolaşabiliyordum. Bu çok fantastikti. Anakin ve Padme arasında Naboo'da romantik anlar olacağını düşünüyordum ve senaryoyu yazarken burası aklımdaydı."

Como tarihi Romalılara kadar uzanıyor. Bu çevrede pek çok eski kale ve villa var. Bunların büyük bahçeleri ve bir kısmının göle kıyısı bulunmakta.İnziva sahneleri için Villa Balbaniello geniş bahçesi ve göl manzaralı terası ile iyi bir seçimdi. Villanın mimari acıdan beklenilenden fazlasını vermesi ILM'in yapının görünümünde sadece ufak değişikliklere gitmesi sonucunu doğurdu. Rick McCallum: "Dijital boyama tekniği kullanılarak yapının üst bölümlerinde değişikliklere gittik.”Mekanın göl ile birleşmesi daha önce olmadığı kadar Anakin-Padme ilişkisinin ön plana çıkmasına ve farklı bir stilde işlenmesine neden oldu.”

Bölüm 2-Klonların Saldırısı’nın gösterime girmesinden sonra birçok elestiri alan Anakin ile Padme'nin arasındaki aşkın betimlenmesi konusunda Lucas şunları söylüyor: "Böyle bir şey yazmak çok zor oldu. American Graffiti'de bir aşk hikayesi yazmıştım fakat burada ortaya koyduğum hikaye eski moda olarak tabir edilen dobra dobra bir aşktı. Bu hikaye 1930'larda ki aşk hikayelerine çok benziyor. Böyle bir aşk hikayesi yazdığım için çok mutluyum ve ortaya çıkan performanstan gayet memnunum. Fakat insanların bunu beğenmeyebileceklerini biliyordum. Birçoğu bu filmi görünce konuşmaları aptalca bulacaktı. Belki bazıları gülecekti Bazıları da ekrana birseller fırlatacaktı Ya da kabul edeceklerdi."

Ben Burtt: "Anakin ile Padme arasında çok fazla kimya vardı. George ve ben büyük savaş sahneleri ve yaratıklar ile ilgili deneyimlere sahiptik. Düzeltme aşamasında bu sahneler üzerinde oldukça kararlı olabiliyorduk. Fakat aşk sahnelerine düzeltme aşamasında daha nazik davranmamız gerekiyordu. Bizim için bu sahneler taze topraklar gibiydi."

Anakin ve Padme'nin inziva sahnelerinden yemek bölümü Lucas ve McCallum tarafından yapım takviminde daha erken bir tarihte yer almasına rağmen ertelendi. Bunun baslıca nedeni Portman ve Christensen'in bu sahnenin çekileceği tarihe kadar birbirlerini daha iyi tanıyacakları düşüncesiydi. Yemek sahnesinde Anakin Jedi yeteneklerini kullanarak meyveyi Padme'ye gönderiyor. Bu sahneye ILM tarafından sonradan eklemeler yapıldı.Ayrıca Jonathan Hales bu sahnelerin tümünde sette bulunuyor ve bazı diyalogları yeniden yazıyordu.

Trisha Biggar Padme'nin giydigi kiyafeti deri ve dantel işleyerek yaptı. Natalie Portman: "Eldivenler ve sıkı yapısı ile güzel bir elbiseydi. Bölüm 2'deki bütün kıyafetlerim Bölüm 1'dekilere göre benim daha kadınsı görünmem için yapılmıştı.” Filmin en romantik sahnesi şömineli odada Anakin ile Padme'nin aralarındaki ilişki hakkında konuştukları bölümdü. Lucas: "Bu sahne bir melodramı yansıtıyordu. Yıldız Savaşları evreninde bir aşk diğer bütün olaylar gibi farklı bir yapıda karsımıza çıkmalı.” Christensen: "İlk okuduğumda çok diyaloğun olduğunu gördüm ve bunu sevdim. Bu tür konuşmalar Yıldız Savaşları’nda kabul edilebilir. Beni rahatsız etmedi."

Piknik sahneleri de Como golünde çekildi Bu sahneyi sonra özel bir boyama tekniği ile arka plan ve bilgisayar ürünü Shaak eklendi. Sahne Paul Newman'ın "Butch Cassidy and Sundance Kid” filmindeki bisikletten düşme sahnesine benziyordu. Hayden Christensen'in Shaakın üzerinde dengede durmaya çalıştığı bölüm tamamen mavi arka plan kullanılarak Avustralya'da çekildi. Daha sonra ILM tarafından dijital birleştirme yapıldı.

Anakin kabusunda annesini görür ve Tatooine gidip annesini bulmak istediğini Padme'ye söyler. Christensen: "Annesi onu rüyalarında ziyaret ediyordu. Anakin annesinin acı içinde olduğunu hissediyordu ve onu kurtarmak istiyordu. Ayni zamanda Padme'yi de koruması gerekiyordu. Aralarındaki aşktan dolayı Padme de onunla gitmek istedi."

İnşa departmanı kereste ve fiberglas kullanarak canlı çekimler için Anakin ve Padme'nin Tatooine’e gideceği gemiyi yaptılar. Peter Wyborn: "Bu bizim en büyük işimizdi. Bütün kontrol panellerini ve düğmeleri yaptık. Ekran aydınlatmaları, konsol, koltuklar ve yüzlerce ayrıntı bir gemide olması gerektiği gibiydi."