Jedi İç Savaşı sırasında Jedi Üstadı Atris tarafından, Telos IV’ün kutup bölgesinde bulunan ve daha önce bir kısmı sulama sistemi olarak kullanılan buz platosunun alt kısmında saklanan bir bölgede kuruldu. Akademi, Yavin Savaşından Önce 3959 yılında Telos IV’ün bombalanmasıyla terk edildi.

Akademi, Dantooine’de bulunan Jedi Yerleşim Bölgesi’nin düşme ihtimali düşünülerek, Jedilar için bir saklanma ve geri çekilme üssü olarak tasarlanmıştı. Telos IV gezegeninin seçilme nedeni, Atris’in Sith’lerin bir gezegeni ikinci defa yok etmeyeceklerini düşünmesiydi. Jedi İç Savaşı sırasında, tarihi öneme sahip holocron ve diğer pek çok materyal gizlice Dantooine’den Telos’a getirildi. Fakat Jediların çok azı, Atris’in aynı zamanda gizli Sith öğretileri içeren Sith holocronlarını da topladığının farkındaydı.

Yavin Savaşından 3956 yıl önce Dantooine Jedi Konseyi, yerleşimin yok edileceğini öngördü fakat Konsey’in Revan'ın tekrar Jedi Düzenine kabul edilmesi için hazırlanması ve Star Forge'u ararken gösterdiği ilerlemenin izlenmesi gibi başka işlere zaman ayırması gerekiyordu.
 

Jedi İç Savaşı’nı takip eden Jedi Katliamı sırasında, Atris, diğer Jediları yaklaşan Sith tehlikesine karşı kayıtsız ve mücadeleye isteksiz kalmaları nedeniyle suçlayarak düzeni terk etti. Yavin Savaşından 3951 yıl önce çok az sayıda Jedi hayatta kalırken, Düzen’in neredeyse yok edilmesi üzerine Atris, yeni düzeni Telos’ta kurmaya karar verdi. Echani Cariyeleri’ni, hiçbir zaman Jedi tekniklerini öğrenmeyecekleri doğrultusunda ant içtirerek, Akademi’ye kabul etti. Böylece Cariyeler, sadece Akademiyi koruyacak, karanlık tarafa geçen ve geçme ihtimali olan Jediları acımasızca katledeceklerdi.
 

Akademideki tek Jedi olan Atris, Enchani Cariyeleri’nin kesin olarak güvendiği tek kişiydi. Kimse akademinin varlığından haberdar olmadığından, Atris kimseyi eğitemedi. Hayatta kalan birkaç Jedi da akademiden haberdar olmakla birlikte, Atris’in ölmüş olduğunu düşünüyordu. Akademiye tek gelen Jedi, bir Echani Cariyesi’nin Ebon Hawk’ı çalması sebebiyle gemisini geri almak için gelen Sürgün Jedi’ydı. Gemisini geri alan Sürgün, Atris’in öğretilerinden şüphe duyar bir halde derhal Telos’u terk etti.
 

Hayatta kalan üç Jedi Üstadı Kavar, Vrook Lamar ve Zez-Kai Ell, Atris’in hayatta olduğunu ve Düzen’i yeniden kurmaya hazırlandığını öğrenmelerine rağmen, bu onlar için fazla bir şey ifade etmedi. Telos yerine, yeniden yapılan Dantooine Jedi Yerleşim Bölgesi’nde buluşmaya karar verdiler. Bu karar, onların sonu oldu.
 

Ancak, Atris, Sithlerin Telos’a ikinci kez saldırmayacağı düşüncesinde yanılmıştı. Kreia’nın kandırmacaları sayesinde Sith Lordu Darth Nihilus, Akademide Jediların olduğunu düşünerek filosunu Telos’a getirdi. Ayrıca, Kreia, Atris’in yozlaşmasını ve karanlık tarafa kayışını açığa çıkartarak Sürgün’le savaşmasını sağladı. Sürgün’ün Atris’in hayatını bağışlamasına rağmen Atris kendi yöntemleri tarafından hayal kırıklığına uğraması nedeniyle gönüllü olarak Düzen’i terk etti.
 

Atris’in Jedi tarihçiliği görevi daha sonra Echani Cariyelerinden biri olan Brianna tarafından üstlenildi. Telos Akademisinin ve içindeki Sith holocronlarının akıbeti bilinmemektedir